教师名录

杨 旸 讲师

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实验室: 智能计算与智能系统重点实验室

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数据挖掘, 机器学习, 生物医学信息处理

2003/09 2009/06,上海交通大学,计算机软件与理论,硕博连读,工学博士

2007/09 – 2009/02,美国加州大学河滨分校,联合培养博士生

1999/09 2003/06,上海交通大学,计算机科学与技术,学士





2014/02 - 至今,上海交通大学,计算机科学与工程系

2012/10 - 2013/10,美国加州大学河滨分校,计算机科学与工程系,访问学者

2009/07 - 2014/02,上海海事大学,信息工程学院



2014春 算法基础

2014秋 离散数学 程序设计思想与方法

2015春 机器学习(研究生) 

2016春 机器学习(研究生、IEEE班)

Selected Publications  

1.  James Wong, Lei Gao, Yang Yang, Wenbo Ma, et al., “Roles of small RNAs in soybean defense against Phytophthora sojae infection,” The Plant Journal , 2014, doi: 10.1111/tpj.12590 

2.  Yang Yang, “Identification of novel type III effectors using latent Dirichlet allocation,” Computational and Mathematical Methods in Medicine, vol. 2012, Article ID 696190 

3.  Yang Yang, Jiayuan Zhao, Robyn L. Morgan, Wenbo Ma, Tao Jiang, “ Computational prediction of type III secreted proteins from gram-negative bacteria,” BMC Bioinformatics, 2010, 11(S1):S47 

4.  Yang Yang and Bao-Liang Lu, “Prediction of protein subcellular multi-localization by using a min-max modular support vector machine,” International Journal of Neural Systems, vol. 20, No. 1, pp. 13-28, 2010. 

5.  Yang Yang, “Computational prediction of type III secreted proteins using labeled and unlabeled data”, International Journal of Infectious Diseases, vol. 14, s2, pp. 37, 2010. 

6.  Dandan Song, Yang Yang (并列一作), Bin Yu, Binglian Zheng, Zhidong Deng, Bao-Liang Lu, Xuemei Chen* and Tao Jiang*, “Computational prediction of novel non-coding RNAs in Arabidopsis thaliana”, BMC Bioinformatics 2009, 10(S1):S36 



主持

2015年1月 -- 2016年12月,植物防御反应中转录与转录后协同调控网络研究,教育部留学回国人员科研启动基金

2014年3月 — 2016年 12月, 用于癌症早期诊断与转移类型识别的肿瘤标志物甄选与作用机理研究, 新教师启动计划

20111 -  201312,革兰氏阴性菌III型分泌系统效应蛋白的计算预测研究,国家自然科学基金(61003093)

20107 - 20127,基于机器学习方法的生物序列分类研究,上海市教委项目

20111 -  201212,基于机器学习方法的大规模蛋白质序列研究,校基金项目

参与

20081 - 201012,大规模多标号不平衡问题分类方法研究,国家自然科学基金

20101 - 201212,基于运动想象的脑-机接口关键技术研究,国家自然科学基金

20103 - 20126,面向交通安全的驾驶员警觉度智能感知系统及关键技术研究,交通部科技项目



Program committee member of 2010 International Symposium on Neural Networks
Program committee member of 2011 International Conference on Neural Information Processing
Deputy Secretary-general for the Noetic Science Association of Shanghai

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